المحتوى
- نظرة عامة على البرنامج
- أنواع الملفات المدعومة
- ملحق الملف الأساسي
- ملحقات الملفات الأخرى المستخدمة بواسطة Integrated Genome Browser 9
| الإصدار (اعتبارًا من 6/29/2016) | 9 |
| منصات | |
| رخصة | المصدر المفتوح |
| الفئة | علمي |
| مزيد من المعلومات (زيارة موقع الناشر) |
| تقييم: 2.8 / 5 (6 أصوات) |
نظرة عامة على البرنامج
الخصائص الرئيسية
- يدعم تنسيقات الجينوم المختلفة مثل GenBank و FASTA
- التفاعل مع البيانات مع التكبير والتحريك الرسوم المتحركة
- الوصول وتحميل الجينوم من مواقع QuickLoad
- تحويل البيانات إلى أشكال الرسم البياني المختلفة
- مشاركة البيانات مع المتعاونين من خلال Dropbox
- تثبيت المكونات الإضافية للحصول على وظائف إضافية
متصفح الجينوم المتكامل (IGB) هو برنامج مفتوح المصدر يستخدم لعرض واستكشاف مجموعات البيانات الجينومية الكبيرة. يمكنك عرض تنسيقات البيانات المختلفة ، والتفاعل مع البيانات الخاصة بك ، وإنشاء الرسوم البيانية ، وحفظ المعلومات الخاصة بك كصور ، وتبادل البيانات لك مع المتعاونين.
يتيح لك IGB عرض البيانات من التعليقات التوضيحية والتسلسلات المحاذاة. يدعم البرنامج مجموعة متنوعة من التنسيقات مثل FASTA و BAM و BEDGRAPH و BigWIG و Cytoband و GenBank. يمكنك أخذ البيانات وتحويلها إلى مجموعة متنوعة من أشكال الرسم البياني بما في ذلك الرسوم البيانية غير المتطابقة لإبراز اختلافات البيانات والرسوم البيانية العميقة لإظهار التغطية. يمكنك أيضًا التفاعل مع بياناتك من خلال الرسوم المتحركة للتكبير والتصغير الخاصة بـ IGB.
يمكّنك IGB من الوصول إلى الجينوم وتحميله من مواقع QuickLoad ، وهي أنظمة بسيطة من الأدلة والتسلسلات وملفات البيانات الأخرى لأغراض التصور. يوفر IGB وظائف متقدمة مع دعم البرنامج المساعد لإضافة وظائف وأتمتة سير العمل من خلال استخدام البرامج النصية. يمنحك IGB أيضًا ميزات متقدمة لمشاركة بياناتك ، سواء كان نشرها في صورة JPEG أو PNG أو SVG عالية الجودة أو تخزين البيانات في Dropbox لمنح المتعاونين الوصول إلى مشروعك.
يستخدم IGB بشكل أساسي من قبل الباحثين الجامعيين وعلماء الأحياء وأخصائيي المعلومات الحيوية. يوفر أدوات متقدمة لفتح مجموعة متنوعة من تنسيقات بيانات الجينوم ، وتصور البيانات كرسومات بيانية مختلفة ، ومشاركة البيانات مع المتعاونين. لسوء الحظ ، يعتمد البرنامج على منح التطوير المستمر ، مما يعني أن دعم التطبيق قد يتوقف في أي وقت. ومع ذلك ، لا يزال Integrated Genome Browser برنامجًا قابلاً للتخصيص وقابل للتخصيص للمستخدمين الذين يتطلعون إلى استكشاف وتحليل بيانات الجينوم الخاصة بهم.
أنواع الملفات المدعومة
ملحق الملف الأساسي
. XML - ملف XMLملحقات الملفات الأخرى المستخدمة بواسطة Integrated Genome Browser 9
| أنواع الملفات المدعومة | |
|---|---|
| .السرير | UCSC BED ملف مسار التعليق |
| .DAS | جلسة تحليل DeltaMaster |
| .FA | تنسيق تسلسل FASTA ملف |
| .FAS | ملف تسلسل FASTA |
| .FASTA | ملف تسلسل FASTA |
| .GB | GenBank ملف البيانات |
| .SGR | SGR ملف بيانات الجينوم |
| .USEQ | USeq ملف بيانات الجينوم |
